Calculadora de massa de dsDNA para concentração molar

Ela usa o número de pares de bases e a massa molecular média por par, com padrão de 660 g/mol por bp. O resultado ajuda você a preparar diluições, normalizar amostras, comparar construções de extensões diferentes e obter entradas baseadas em moléculas a partir de medições de massa. Você pode alterar a massa média quando seu protocolo ou modelo exigir outra premissa.

Informe a concentração em massa e a extensão correta

Comece pela concentração em massa medida do DNA de fita dupla e selecione a unidade correspondente. São aceitos ng/µL, µg/mL, mg/mL e g/L, todos normalizados para gramas por litro. Depois informe, como inteiro positivo, a extensão de uma molécula em pares de bases. Inclua vetor, inserto, adaptadores e qualquer outro trecho de fita dupla presente em cada molécula. Um plasmídeo de 5,000 bp deve ser informado como 5000, e não apenas pela extensão de uma região. A extensão é decisiva porque massas iguais de DNA curto e longo contêm quantidades diferentes de moléculas; quanto menor a molécula, maior sua molaridade para a mesma massa. A massa pode ser zero, mas o número de pares de bases precisa ser positivo. Valores não finitos, contagens fracionárias, concentrações negativas e unidades incompatíveis são rejeitados para impedir resultados aparentemente válidos a partir de dados incorretos.

Entenda a aproximação e a fórmula

O cálculo estima primeiro a massa molecular de uma molécula multiplicando o número de pares de bases pela massa média de cada par. O padrão de 660 g/mol por bp é uma aproximação comum para DNA de fita dupla. Assim, uma construção de 5,000 bp tem massa estimada de 3,300,000 g/mol. A molaridade é a concentração em g/L dividida por essa massa em g/mol, resultando em mol/L; a resposta também apresenta µM, nM e pM. Por exemplo, 50 ng/µL equivalem a 0.05 g/L e, para 5,000 bp, resultam em cerca de 1.515 × 10^-8 mol/L ou 15.15 nM. Como 660 é uma média, e não uma massa exata calculada pela sequência, você pode substituí-la quando um kit ou método especificar outro valor. A resposta informa a premissa e a massa molecular total, permitindo auditar a conversão.

Use o resultado com critério no laboratório

Use a molaridade retornada para comparar construções pelo número de moléculas, planejar pools equimolares, calcular diluições ou converter uma medição fluorométrica para protocolos de ligação e sequenciamento. Confirme que todas as entradas sejam DNA de fita dupla e que a extensão represente a forma molecular real. A ferramenta não mede concentração, não infere extensão, não analisa sequências, não corrige pureza e não modela distribuições de fragmentos. Para DNA fragmentado, uma extensão média ou modal produz apenas uma aproximação que deve ser registrada. Leituras por absorbância podem incluir contaminantes, e modificações incomuns podem exigir outra massa média. Portanto, a precisão depende da medição, da extensão e da premissa fornecidas. O algoritmo é determinístico, não acessa a rede e sempre repete o resultado para a mesma entrada. O navegador e a API usam o mesmo cálculo; cada solicitação automatizada válida custa US$ 0,002.