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Calculateur du rapport AT/GC selon les bases de l’ADN

Le calculateur du rapport AT/GC compare la somme de l’adénine et de la thymine à celle de la guanine et de la cytosine dans une molécule d’ADN.

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Saisissez les quatre décomptes pour obtenir les totaux AT et GC, le quotient numérique, un rapport simplifié et le pourcentage de chaque groupe. Ce calcul déterministe permet de contrôler rapports, exercices et données génomiques sans transmettre toute la séquence.

Ce que représente le rapport AT/GC

La composition de l’ADN est souvent résumée en regroupant l’adénine avec la thymine, puis la guanine avec la cytosine. L’outil additionne A+T et G+C, puis divise le premier total par le second. Une valeur de 1 signifie que les quantités sont égales ; au-dessus de 1, AT domine, et en dessous, GC domine. `at_gc_ratio_text` réduit la relation à des entiers : 60 et 40 donnent 3:2. Les pourcentages prennent les quatre bases comme total et valent ensemble 100, sous réserve de l’arrondi. Ils décrivent la composition, pas la position des bases, les gènes ou les régions régulatrices.

Saisir et interpréter les décomptes

Indiquez quatre entiers positifs ou nuls dans `adenine`, `thymine`, `guanine` et `cytosine`. Employez zéro lorsqu’une base est absente, sans omettre de champ. Le calculateur produit `at_count`, `gc_count` et `total_bases`, arrondit le quotient à douze décimales au maximum et conserve le rapport entier exact. Quatre zéros ne définissent aucune composition. Si GC vaut zéro, la division est indéfinie et la requête renvoie une erreur plutôt qu’une valeur infinie trompeuse.

Périmètre, hypothèses et bon usage

Utilisez cet outil si vous disposez déjà du décompte des quatre bases canoniques. Il ne lit ni FASTA, ni FASTQ, ni séquence brute et ne classe pas les symboles ambigus N, R ou Y. Il ne déduit pas non plus température de fusion, stabilité, fonction, organisme ou diagnostic. Pour comparer des échantillons, appliquez la même méthode et documentez le traitement des bases ambiguës. Ce calcul convient à l’enseignement, aux contrôles reproductibles et aux pipelines légers ; seul, il ne justifie aucune conclusion biologique ou clinique.

Contrôler un rapport de composition

Transformez les décomptes A, T, G et C en totaux et rapport AT/GC vérifiables.

Comparer des échantillons d’ADN

Produisez les mêmes champs pour des échantillons comptés selon une méthode commune.

Enseigner la composition nucléotidique

Montrez comment quatre décomptes deviennent totaux, rapport et pourcentages.

Quel est le prix du calcul par API ?

Chaque requête coûte $0.002. Le même calcul déterministe fonctionne aussi dans le navigateur.

Comment le rapport AT/GC est-il calculé ?

Le calculateur additionne adénine et thymine, puis guanine et cytosine, et divise le premier total par le second.

Pourquoi refuser un total GC nul ?

GC est le dénominateur ; une division par zéro ne définit aucun rapport fini.

Puis-je saisir des pourcentages ?

Non. Saisissez quatre entiers positifs ou nuls ; l’outil calcule les pourcentages.

L’outil compte-t-il les bases d’une séquence ?

Non. Il utilise des décomptes existants et ne traite ni séquence, ni FASTA, ni FASTQ.

Tout sur cette page est disponible par programmation. Cette section s'adresse aux équipes qui veulent l'intégrer à leurs systèmes ; les autres peuvent simplement utiliser l'outil ci-dessus.

POSThttps://api.kit.forhosting.com/bio/at-gc-ratio

Authentification par jeton Bearer : un seul POST met la tâche en file d’attente, et le résultat vous parvient par webhook ou lien signé.

curl -X POST https://api.kit.forhosting.com/bio/at-gc-ratio \
  -H "Authorization: Bearer $KIT_KEY" \
  -H "Content-Type: application/json" \
  -d '{"adenine":30,"thymine":30,"guanine":20,"cytosine":20}'
{
  "adenine": 30,
  "thymine": 30,
  "guanine": 20,
  "cytosine": 20
}
{
  "task_id": "tsk_a1b2c3d4e5f6a1b2c3d4e5f6",
  "type": "bio.at_gc_ratio",
  "status": "queued",
  "_links": {
    "result": "/tasks/tsk_…/result"
  }
}

L’API est asynchrone : chaque appel renvoie un task_id immédiatement, puis vous interrogez l’état à raison d’une requête par seconde.

par requête$0.002

Le prix est publié, sans tokens ni crédits. Une tâche qui échoue n’est pas facturée.

HTTPCodeSignification
401unauthorizedClé API absente ou invalide : vérifiez l’en-tête Authorization.
402insufficient_balanceSolde insuffisant : rechargez votre compte pour lancer cette tâche.
404unknown_typeType de tâche inconnu : vérifiez le champ type de votre requête.
429rate_limitedTrop de requêtes : ralentissez la cadence, puis réessayez.

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