ForHosting KIT · أدوات المطورين

حساب عدد لفات الحلزون في DNA من أزواج القواعد

تحوّل حاسبة لفات حلزون DNA هذه طول جزيء DNA المقاس بأزواج القواعد إلى عدد اللفات الحلزونية المقابل.

● Betaمجاني · داخل متصفحك

استخدمها من الويبAPIالبريدTelegramالتطبيق قريبًا

وهي تستخدم التقريب الشائع لبنية B-DNA، وهو 10.5 زوجًا من القواعد لكل لفة، وتعرض الافتراض والصيغة إلى جانب النتيجة. أدخلوا طولًا صحيحًا غير سالب للحصول على قيمة حتمية تفيد في التقديرات المختبرية السريعة والتعليم وملاحظات البروتوكولات ومسارات البرمجيات القابلة للتكرار. لا يتطلب الحساب تسلسلًا جينيًا، كما أنه لا يستنتج هيئة DNA من الظروف التجريبية.

أدخلوا طول DNA بأزواج القواعد

أدخلوا الطول الكلي لجزيء DNA في صورة عدد صحيح من أزواج القواعد. بالنسبة إلى القطعة الخطية، يكون هذا عادةً حجم القطعة الناتج من تحليل التسلسل أو خريطة مواقع القطع أو التجميع أو التقدير بالرحلان الكهربائي. أما البلازميد الدائري، فاستخدموا طوله الكامل بما يشمل الهيكل الأساسي وكل التسلسلات المدرجة. تقبل الحاسبة الصفر بوصفه حالة حدية رياضية، وترفض القيم السالبة والكسرية وغير الرقمية والأعداد الصحيحة غير الآمنة، لأن الطول المقاس بأزواج القواعد يمثل عددًا منفصلًا. لا تدخلوا عدد نيوكليوتيدات شريط منفرد إلا إذا كان يطابق مباشرةً عدد المواضع المزدوجة في الجزيء ثنائي الشريط محل الدراسة. كذلك لا تدخلوا الوزن الجزيئي أو الكيلوقواعد من دون تحويل أو طول المحيط الفيزيائي. حوّلوا الكيلوقواعد إلى أزواج قواعد بضربها في 1000 قبل الإدخال. إن توضيح مصدر الطول ووحدته يمنع خطأً بسيطًا في المقياس من إنتاج نتيجة أكبر أو أصغر بعشرة أمثال أو ألف مثل.

افهموا افتراض 10.5 زوجًا من القواعد

يقسم الحساب عدد أزواج القواعد المدخل على 10.5، وهو متوسط شائع الاستخدام للدورية الحلزونية في B-DNA. فعلى سبيل المثال، يعادل طول 105 أزواج من القواعد 10 لفات حلزونية وفق هذا التقريب. وتكون النتيجة الكسرية ذات معنى، إذ تعبّر عن ذلك العدد من الدورات المتوسطة ولا تعني أن كل جزيء يجب أن ينتهي بعد لفة صحيحة. تعرض النتيجة المعامل الثابت وصيغة واضحة لتيسير التحقق منها وتسجيلها. تمثل القيمة 10.5 اصطلاحًا مثاليًا وليست قياسًا للجزيء المدخل. فقد تتغير الدورية الفعلية بحسب التسلسل والترطيب وتركيز الأملاح ودرجة الحرارة وإجهاد الالتواء وارتباط البروتينات والمركبات المتداخلة والطوبولوجيا. وللبنى الأخرى، ومنها A-DNA وZ-DNA، أشكال هندسية مختلفة، لذلك لا ينبغي تفسيرها بهذا المعامل. استخدموا هذه الحاسبة عندما يلائم تقريب البنية B غرض التقدير، واحتفظوا بذكر هذا الافتراض عند الإبلاغ عن النتيجة أو مقارنتها.

استخدموا النتيجة بمستوى الدقة المناسب

تعاملوا مع عدد اللفات الناتج بوصفه تقديرًا هندسيًا واضح الافتراضات. ويمكن أن يساعد في مقارنة أطوال القطع وشرح الطور الدوراني وإعداد أمثلة تعليمية وتوصيف تصاميم التراكيب أو تزويد مسار بيانات بقيمة مشتقة متسقة. عندما يفصل بين موقعين مضاعف صحيح لنحو 10.5 زوجًا من القواعد، يكونان متحاذيين دورانيًا بصورة تقريبية وفق النموذج المبسط؛ أما إزاحة نصف لفة فتضعهما تقريبًا على وجهين متقابلين. ومع ذلك، لا تتنبأ هذه العملية الحسابية وحدها بالانحناء أو سهولة الوصول أو نشاط المحفز أو موضع النيوكليوسومات أو الالتفاف الفائق أو تفاعل البروتين مع DNA. تتطلب هذه المسائل سياق التسلسل وتحليلًا تجريبيًا أو بنيويًا أكثر تفصيلًا. تجنبوا تقريب قيمة الإدخال، ولا سيما للقطع القصيرة، لأن فرق زوج واحد من القواعد يعادل نحو عُشر لفة. قرّبوا النتيجة النهائية فقط إلى الدقة التي يبررها الاستخدام. توفر API قيمة عددية مستقرة للأتمتة، بينما يسهّل المعامل والصيغة مراجعتها. تبلغ كلفة كل عملية حساب عبر API مقدار $0.002، ويمكن استخدام العملية الحتمية نفسها بصورة تفاعلية أيضًا.

حالات الاستخدام

تقدير لفات قطعة DNA

حوّلوا طول ناتج تضخيم أو قطعة تقييد أو تسلسل مجمّع إلى عدد تقريبي من لفات B-DNA.

مقارنة التباعد الدوراني

اربطوا المسافة بأزواج القواعد بين موقعين باللفات الصحيحة والكسرية وفق افتراض موحّد قدره 10.5 زوجًا.

أتمتة توصيف التراكيب

أضيفوا قيمة قابلة للتكرار لعدد اللفات الحلزونية إلى سجلات البلازميدات أو بيانات التعليم أو مسارات الحساب المختبرية.

الأسئلة الشائعة

ما الصيغة التي تستخدمها الحاسبة؟

تستخدم الصيغة: عدد اللفات الحلزونية = عدد أزواج القواعد / 10.5.

لماذا يُستخدم 10.5 زوجًا من القواعد لكل لفة؟

تمثل القيمة عشرة فاصلة خمسة تقريبًا متوسطًا شائعًا للدورية الحلزونية في B-DNA تحت الظروف المعتادة.

هل يمكن أن تتضمن النتيجة كسرًا من اللفة؟

نعم. تمثل القيمة الكسرية الامتداد الدوراني المتوسط بعد آخر لفة كاملة.

هل تصلح الحاسبة لبنيتي A-DNA أو Z-DNA؟

لا. لهاتين البنيتين هندسة حلزونية مختلفة، ولذلك لا يناسبهما التقريب الثابت الخاص بـB-DNA.

هل يجب إدخال أزواج القواعد أم الكيلوقواعد؟

أدخلوا أزواج القواعد. اضربوا الطول بالكيلوقواعد في 1000 قبل استخدام الحاسبة.

ما كلفة عملية الحساب عبر API؟

تبلغ كلفة كل طلب إلى API مقدار $0.002.

للمطوّرين — الوصول عبر API

كل ما في هذه الصفحة متاح برمجيًا. هذا القسم موجّه للفرق التقنية التي تريد ربط الأداة بأنظمتها الخاصة؛ بقية المستخدمين يمكنهم استخدام الأداة أعلاه مباشرة دون الحاجة لقراءة ما يلي.

الـEndpoint

POSThttps://api.kit.forhosting.com/bio/dna-helical-turns

صادِق على طلبك بترويسة Bearer، وأرسل طلب POST واحدًا لتدخل مهمتك قائمة التنفيذ فورًا؛ ثم تستلم النتيجة عبر webhook أو رابط موقّع.

استدعِ الخدمة من بيئتك

curl -X POST https://api.kit.forhosting.com/bio/dna-helical-turns \
  -H "Authorization: Bearer $KIT_KEY" \
  -H "Content-Type: application/json" \
  -d '{"base_pairs":1050}'

const res = await fetch("https://api.kit.forhosting.com/bio/dna-helical-turns", {
  method: "POST",
  headers: {
    "Authorization": `Bearer ${process.env.KIT_KEY}`,
    "Content-Type": "application/json"
  },
  body: JSON.stringify({
    "base_pairs": 1050
  })
});
const { task_id } = await res.json();

import os, requests

res = requests.post(
    "https://api.kit.forhosting.com/bio/dna-helical-turns",
    headers={"Authorization": f"Bearer {os.environ['KIT_KEY']}"},
    json={
    "base_pairs": 1050
},
)
task_id = res.json()["task_id"]

<?php
$res = file_get_contents("https://api.kit.forhosting.com/bio/dna-helical-turns", false, stream_context_create([
  "http" => [
    "method"  => "POST",
    "header"  => "Authorization: Bearer " . getenv("KIT_KEY") . "\r\nContent-Type: application/json",
    "content" => '{"base_pairs":1050}',
  ],
]));
$task = json_decode($res, true);

body := bytes.NewBufferString(`{"base_pairs":1050}`)
req, _ := http.NewRequest("POST", "https://api.kit.forhosting.com/bio/dna-helical-turns", body)
req.Header.Set("Authorization", "Bearer "+os.Getenv("KIT_KEY"))
req.Header.Set("Content-Type", "application/json")
res, _ := http.DefaultClient.Do(req)

مثال على الطلب

{
  "base_pairs": 1050
}

مثال على الاستجابة

{
  "task_id": "tsk_a1b2c3d4e5f6a1b2c3d4e5f6",
  "type": "bio.dna_helical_turns",
  "status": "queued",
  "_links": {
    "result": "/tasks/tsk_…/result"
  }
}

الواجهة غير متزامنة: تستلم task_id فور الإرسال، ويمكنك الاستعلام عن الحالة بمعدل طلب واحد في الثانية.

الأسعار

لكل طلب$0.002

السعر معلن كما تراه: لا tokens ولا نظام نقاط؛ وإن فشلت المهمة فلن تُحاسَب عليها.

الأخطاء

HTTP	الرمز	المعنى
`401`	`unauthorized`	مفتاح الوصول مفقود أو غير صالح؛ تحقق من ترويسة Bearer في طلبك.
`402`	`insufficient_balance`	رصيدك لا يكفي لتنفيذ هذه المهمة؛ أعد شحن الرصيد ثم أعد المحاولة.
`404`	`unknown_type`	نوع المهمة المطلوب غير موجود في الكتالوج — راجع الاسم المرسل في الطلب.
`429`	`rate_limited`	تجاوزت الحد المسموح من الطلبات؛ انتظر قليلًا ثم أعد المحاولة.

اطّلع على توثيق KIT الكامل ←