Distancia de mapa aditiva con corrección de doble cruce

Introduzca la distancia del gen A al gen B y del gen B al gen C, ajuste si corresponde el coeficiente de coincidencia y obtenga tanto la longitud total del mapa como una estimación de la recombinación entre los genes externos corregida por cruces dobles. La herramienta distingue la distancia genética de la recombinación observable y facilita ejercicios, análisis de cruzamientos de prueba y revisiones reproducibles de mapas de tres puntos.

Introduzca intervalos adyacentes en el orden conocido

Utilice esta calculadora después de establecer el orden A-B-C. Introduzca en el primer campo la distancia entre A y B, y en el segundo la distancia entre B y C. Ambas se expresan en centimorgan, también llamados unidades de mapa. La herramienta admite cada intervalo entre 0 y 50 centimorgan. No deduce el orden génico a partir de clases de descendientes, no identifica fenotipos parentales o recombinantes y no decide qué marcador ocupa la posición central. Esos pasos deben estar resueltos previamente. Las letras A, B y C son etiquetas genéricas que usted puede asociar con tres genes cualesquiera, siempre que B sea el gen central. No introduzca una distancia entre genes externos como uno de los intervalos, pues contaría dos veces parte del cromosoma. La distancia aditiva devuelta es la suma de A-B y B-C y representa el trayecto del mapa, aunque la recombinación observable entre A y C resulte menor debido a los cruces dobles.

Aplique correctamente la corrección por doble cruce

Para estimar ausencia de interferencia, conserve el coeficiente de coincidencia predeterminado de 1. La calculadora convierte los dos porcentajes adyacentes en proporciones, los multiplica para obtener la frecuencia de cruces dobles esperada bajo independencia y vuelve a expresarla como porcentaje. Si el experimento proporciona un coeficiente de coincidencia, introduzca un valor entre 0 y 1. La frecuencia independiente se multiplica por ese coeficiente para producir la estimación ajustada. Un coeficiente inferior a 1 representa interferencia positiva y, por tanto, menos cruces dobles de los esperados. Cada cruce doble debe restarse dos veces al estimar la recombinación de los marcadores externos: aparece una vez en cada intervalo adyacente, pero restablece la combinación parental de los genes externos. Por ello, el porcentaje corregido es la suma de los intervalos menos dos veces el porcentaje ajustado de cruces dobles. La salida muestra por separado las estimaciones independiente y ajustada para que usted pueda auditar el cálculo completo.

Interprete por separado la longitud y la recombinación externa

Interprete la distancia de mapa aditiva como la longitud genética estimada que abarca los tres genes. Interprete el porcentaje de recombinación externa corregido como la fracción de gametos que parecerían recombinantes si solo se observaran A y C bajo los supuestos indicados. Son resultados diferentes y no deben sustituirse entre sí. La longitud aditiva conserva las aportaciones de los cruces en ambos intervalos, mientras que la observación de los marcadores externos oculta los cruces dobles. Esta diferencia aumenta cuando crece cualquiera de los intervalos. El cálculo usa la aproximación convencional que trata los centimorgan de un intervalo como su porcentaje de recombinación al estimar cruces dobles. Es apropiada sobre todo para ejercicios clásicos y distancias relativamente cortas. En intervalos largos o análisis formales, emplee recuentos de descendientes y una función de mapeo o un modelo de verosimilitud. Informe los dos intervalos, el orden génico, el coeficiente y la corrección para que el resultado sea reproducible.